Tomoki Sakurai est un simple lycéen qui cherche à vivre une vie calme et paisible. Cependant, il fait toujours ce même rêve étrange où une femme lui demande de l'aider. Un jour, il en parle avec Sugata, un de ses aînés, et celui-ci est convaincu que c'est un message provenant d'un nouveau monde à découvrir. Plus tard dans la soirée, quand Tomoki attend ses amis, un ange tombe du ciel... et toute sa vie se retrouve alors complètement bouleversée par cette rencontre. Mais il ne se doutait pas que ce n'était que le début.

Ce film résume en quelque sorte les deux premières saisons en y reprenant divers événements mais en ce concentrant cette fois-ci autour d'un nouveau personnage, Kazane Hiyori, une jeune fille secrètement amoureuse de notre héros et qui va alors essayer d'attirer son attention en entrant dans le club de recherche du nouveau monde. Mais alors qu'elle semble bien s'être intégrer au groupe, certains doute pèse sur son existence. Existe-t-elle réellement ? Ou est-elle une illusion ?