La série se passe dans un univers où les Terriens sont parvenus à coloniser l'espace. Cependant, cette colonisation ne se fait pas sans difficultés : le corps humain n'est pas génétiquement prêt à affronter certaines conditions de vies. Par ailleurs, il s'avère que les Terriens ne sont pas les seuls êtres de l'univers intéressés par la conquête spatiale, et que celle-ci ne se fera pas sans combats. Dans l'optique d'optimiser leurs chances, les Terriens ont donc, grâce aux progrès en matière de génétique, créer des enfants plus adaptés à la vie dans l'espace : c'est le projet MJP. Izuru, le personnage principal, est l'un de ces enfants. Il intègre l'académie Grandzehle, comme d'autres enfants "spéciaux", afin de protéger l'humanité de ce qui la menace.

Les événements de cet épisode 25 se déroulent en parallèle de la fin de la saison 1.Sei, Yui, Chris et Anne sont quatre étudiants du projet MJP. Très doués dans leurs domaines, ils aspirent à devenir de grands pilotes, comme leurs idoles de la Team Rabbit. Malheureusement, alors que la bataille finale est sur le point de débuter, ils sont les seuls élèves de leur classe contraints de rester sur Terre.