D’apparence normale, Saya Kisaragi est une jeune lycéenne tête en l’air et qui fait tout pour aider son prochain. Son père, Tadayoshi, est un prêtre shintoïste avec qui elle vit. Ce dernier lui a confié la mission de détruire les « Anciens ». Saya, armée de son épée sacrée, traque ces monstres dont les apparitions sont de plus en plus fréquentes et représentant un danger pour les humains. Par ailleurs, la lycéenne à de violents maux de tête qui lui lasse voir plusieurs visions qu’elle n’arrive pas à comprendre. Que représentent ces visions ?

L'histoire se déroule un an après les événements de la série animée. Kisaragi Saya est une jeune lycéenne, vivant avec son père adoptif dans un temple shintô. De nature maladroite, tête en l’air, naïve mais cependant très serviable, elle ne peut s’empêcher de faire le bien autour d’elle. Malgré les apparences, la nuit, Saya change de nature et prend part à des combats sanglants contre des monstres en tout genre. En effet, Saya est en réalité une des vampire les plus puissantes qui puissent exister, travaillant pour le gouvernant afin de protéger la ville.

Pendant la guerre du Vietnam, une sanguinaire guerrière massacre tout sur son passage sans aucune pitié: monstres, soldats américains ou même innocents villageois y passent. De nos jours, Saya Otanashi jeune lycéenne sans histoire d'Okinawa s'entraîne pour une compétition de saut en hauteur malgré une "maladie" qui l'oblige à se faire transfuser régulièrement à l'hôpital. Bien qu'elle vive en famille, elle semble avoir perdu la mémoire car elle ne peut se souvenir des évènements de sa vie avant son adoption (soit presque un an). Mais un soir, l'attaque par une monstrueuse créature appelée "chiroptère" et l'intervention d'un mystérieux allié surgissant de son passé oublié vont faire ressortir la guerrière sommeillant en elle. -Samir-

Il s'agit de 2 épisodes spéciaux faisant office de résumé de la série originale en y ajoutant des scènes inédites, ces épisodes ont été diffusés peu avant le film Blood-C : The Last Dark afin de remémorer l'histoire aux spectateurs.

Dans un Japon post-Seconde Guerre mondiale, Saya, une vampire, lutte contre des démons vampiriques. L’histoire se déroule dans la base américaine de Yokota, située dans un Japon post-Seconde Guerre mondiale, quelques mois avant le début de la guerre du Viêt Nam. Son principal protagoniste est une fille nommée Saya, qui chasse des démons vampires (appelés Chiroptans) en utilisant un katana. Elle travaille pour le gouvernement américain.